خبرگزاری مهر ۱۸ اسفند ۱۳۸۱ فعالیت آزمایشی خود را با مدیریت پرویز اسماعیلی، دیپلمات و سفیرپیشین، آغاز کرده و در ۲۹ اردیبهشت ۱۳۸۲ به صورت آزمایشی بر روی شبکه اینترنت قرار گرفت. خبرگزاری مهر سوم تیرماه سال ۱۳۸۲ همزمان با روز اطلاع‌رسانی دینی فعالیت رسمی خود را به دو زبان فارسی و انگلیسی آغاز کرد و بخش عربی «مهر» نیز ۱۴ دی ۱۳۸۲، فعال شد. خبرگزاری مهر وابسته به سازمان تبلیغات اسلامی و عضو سازمان خبرگزاری‌های آسیا و اقیانوسیه است. و روزنامه انگلیسی‌زبان تهران‌تایمز نیز ذیل مجموعه رسانه‌ای مهر درحال فعالیت است.
خبرگزاری مهر، مسائل؛ سیاسی، فرهنگی، اجتماعی، هنری و… را در سایت خود دنبال می‌کند اما بحث‌های فرهنگی در این سایت خبری رونق بیشتری دارد.
محمد مهدی رحمتی، رئیس پیشین بسیج سازمان صدا و سیما و معاون استان‌های رسانه ملی درحال حاضر مدیر مسول مجموعه رسانه‌ای مهر و محمدحسین معلم طاهری، به عنوان معاون خبر در این رسانه مشغول به فعالیت است.
